Le Laboratoire d’innovation numérique de la Commission Nationale de l'Informatique et des Libertés (CNIL) a publié une cartographie des entrepôts de données de santé (EDS) en France, un outil destiné à documenter les initiatives des acteurs du secteur et à renforcer la transparence sur l'utilisation des données de santé.

Ces bases de données, constituées sur le long terme pour la recherche et le pilotage, sont gérées par des acteurs publics comme privés. L'outil vise à informer les personnes concernées sur l'usage de leurs données et à aider les chercheurs à identifier des projets pertinents. Il fournit des fiches détaillant l'acteur (nom, statut, localisation), l'entrepôt (description, date d'autorisation ou de déclaration de conformité) et les éventuels réseaux de mutualisation. Au 1er septembre 2025, la cartographie recensait 125 entrepôts créés depuis 2017 par 102 acteurs différents, dont 45 du secteur public, 32 du secteur privé à but non lucratif et 25 du secteur privé.